Python实现二值掩膜影像去噪与边缘强化方法详解
前言
这篇博客主要解决的一个问题是掩膜图像的噪声去除和边缘强化,如下图1所示。可以看到掩膜图像上有很多的斑点噪声,而且掩膜的轮廓也不够清晰。所以我们的目标就是一方面尽可能把这些斑点噪声去除,另一方面尽量突出掩膜边界。另外处理后的掩膜可以比真值大一些,但最好不能小。
图1 原始二值化影像
一、方法
因为之前有做过相关的工作,所以对于保留边界的斑点噪声消除第一反应是使用中值滤波。但很显然对于我们这个应用,单纯中值滤波是不够的。所以就想着那就采用多步处理,融合形态学操作。因此设计了一种如下图所示的方法。
图2 二值掩膜影像去噪与边缘强化技术路线图
中值滤波比较好理解,就是为了消除斑点噪声。而腐蚀操作这是为了处理一些稍大的面状的噪声,通过多次的腐蚀,尽可能消除它们。而后续的3次膨胀操作则是对应3次腐蚀,恢复成“原样”。然后是一个二值化,目的在于进一步去除一些噪声并且强调轮廓。因为有一些较暗的像素经过3次膨胀就会形成很大一块区域。因此,通过二值化可以过滤掉。最后膨胀一方面是为了满足要求“比真值大一些”,另一方面是填充由于腐蚀或者二值化带来的一些空洞。
二、代码
Python版本代码实现如下,非常简单。
import cv2 import numpy as np import os def findFiles(root_dir, filter_type, reverse=False): print("Finding files ends with \'" + filter_type + "\' ...") separator = os.path.sep paths = [] names = [] files = [] for parent, dirname, filenames in os.walk(root_dir): for filename in filenames: if filename.endswith(filter_type): paths.append(parent + separator) names.append(filename) for i in range(paths.__len__()): files.append(paths[i] + names[i]) print(names.__len__().__str__() + " files have been found.") paths.sort() names.sort() files.sort() if reverse: paths.reverse() names.reverse() files.reverse() return paths, names, files if __name__ == '__main__': root_dir = "./mask" # 影像的输入路径 out_dir = "./mask/refine" # 结果的输出路径 file_type = ".jpg" # 文件类型 median_kernel = 7 # 中值滤波卷积核大小 morph_kernel1 = 5 # 形态学操作卷积核大小1 morph_kernel2 = 5 # 形态学操作卷积核大小2 morph_iter1 = 3 # 形态学操作迭代次数1 morph_iter2 = 3 # 形态学操作迭代次数2 paths, names, files = findFiles(root_dir, file_type) kernel1 = np.ones((morph_kernel1, morph_kernel1), np.uint8) kernel2 = np.ones((morph_kernel2, morph_kernel2), np.uint8) for i in range(len(files)): img_gray = cv2.imread(files[i], cv2.IMREAD_GRAYSCALE) # 主要流程:先做一次中值滤波,去除零碎像素噪声点 # 然后再做3次腐蚀操作去除一些噪声块,再做3次膨胀操作填充回来 # 然后,做个Otsu二值化,把一些潜在的噪声去除 # 最后,为了使掩膜尽可能包含真值,再做一次膨胀操作 img_median = cv2.medianBlur(img_gray, ksize=median_kernel) img_erode = cv2.erode(img_median, kernel1, iterations=morph_iter1) img_dilate = cv2.dilate(img_erode, kernel1, iterations=morph_iter1) ret, img_threshold = cv2.threshold(img_dilate, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU) img_mask = cv2.dilate(img_threshold, kernel2, iterations=morph_iter2) # 绘制轮廓,可视化,以及保存 _, contours, _ = cv2.findContours(img_mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE) img_rgb = cv2.cvtColor(img_gray, cv2.COLOR_GRAY2BGR) img_contours = cv2.drawContours(img_rgb, contours, -1, (0, 0, 255)) cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_refine.jpg", img_mask) cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_range.jpg", img_contours) # 如果需要查看每一步结果,可以把下面这些注释掉 # cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_median.jpg", img_median) # cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_erode.jpg", img_erode) # cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_dilate.jpg", img_dilate) # cv2.imwrite(out_dir + "/" + names[i].split(".")[0] + "_threshold.jpg", img_threshold) print(i + 1, "/", len(files))
三、效果测试
为了测试效果,输出了中间过程的结果。如下是输入的原始影像。
然后首先进行中值滤波,结果如下。
然后进行3次腐蚀操作,以去除一些噪声,如下。
为了保证掩膜和输入一样,再膨胀3次,结果如下。
由于掩膜是0-1影像,为了过滤掉一些中间值,进行一次二值化,结果如下。
二值化以后难免会有一些空洞,因此使用膨胀操作进行填充,最终生成的掩膜如下。
将生成的掩膜范围绘制到输入影像上(红色框线)如下图所示。
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