详解Pytorch+PyG实现GCN过程示例

 更新时间:2023年04月21日 10:09:34   作者:实力  
这篇文章主要为大家介绍了Pytorch+PyG实现GCN过程示例详解,有需要的朋友可以借鉴参考下,希望能够有所帮助,祝大家多多进步,早日升职加薪

一、模型结构

在图神经网络的研究中,GCN(Graph Convolutional Networks)是一种比较常见且有效的模型。

在GCN模型中,每个节点都包含了该节点邻居节点信息的聚合,这意味着它是一个全局性模型。一个典型的GCN模型通常由两部分组成:一个基于消息传递算法的卷积层以及一个多层感知器。其中,前者主要完成特征融合,后者负责分类任务。

对于一个具有n个节点的图G,其特征矩阵X可以表示为:

步骤如下:

  • 构建一个两层的卷积网络:第一层是GCN层,后面跟着ReLU激活和一个随机失活层;第二层是输出分类器。
  • 模型在训练期间根据具体的损失函数(如交叉熵损失)进行优化,并用于预测新数据。

二、PyTorch实现

PyTorch使用dgl库可以方便地构建图,PyG也提供了类似的工具。接下来看一下如何使用PyTorch + PyG实现一个简单的GCN模型,以Cora数据集为例。

准备数据

Cora是一个分类任务的数据集,其中包含2708个文本节点名称,以及每个节点的1433维特征(词汇相关性)。首先,我们需要在PyG中将其转换为一个带有相应边缘信息的图形对象。具体而言,使用pyg.data.dataset工具加载Cora数据集,然后将其转换为一个PyG图。

from torch_geometric.datasets import Planetoid
import torch_geometric.transforms as T
dataset = Planetoid(root='/path/to/dataset', name='Cora', transform=T.NormalizeFeatures())
data = dataset[0]
print(data)

定义GCN模型

在定义PyG的GCN网络之前,需要定义Convolutional Layer,这个层以邻接矩阵A作为输入,通过权重权值矩阵W来散播消息,并输出一个新特征向量。

import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.nn import GCNConv
class Net(torch.nn.Module):
    def __init__(self):
        super(Net, self).__init__()
        self.conv1 = GCNConv(dataset.num_features, 16)
        self.conv2 = GCNConv(16, dataset.num_classes)
    def forward(self, x, edge_index):
        x = self.conv1(x, edge_index)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.conv2(x, edge_index)
        return F.log_softmax(x, dim=1)

定义训练过程

训练具体流程如下:

  • 对于每个epoch,进行随机梯度下降优化。我们选择交叉熵作为损失函数,并使用Adam作为优化器。
  • 在测试期间,用验证集对精确度进行评估。
device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu')
model = Net().to(device)
data.to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4)
def train():
    model.train()
    optimizer.zero_grad()
    out = model(data.x, data.edge_index)
    loss = F.nll_loss(out[data.train_mask], data.y[data.train_mask])
    loss.backward()
    optimizer.step()
def test():
    model.eval()
    _, pred = model(data.x, data.edge_index).max(dim=1)
    correct = int(pred[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item())
    acc = correct / int(data.test_mask.sum())
    return acc
for epoch in range(1, 201):
    train()
    test_acc = test()
    print(f'Epoch: {epoch:03d}, Test Acc: {test_acc:.4f}')

以上就是详解Pytorch+PyG实现GCN过程示例的详细内容,更多关于Pytorch PyG实现GCN的资料请关注脚本之家其它相关文章!

相关文章

  • python-httpx的使用及说明

    python-httpx的使用及说明

    这篇文章主要介绍了python-httpx的使用及说明,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教
    2022-11-11
  • django mysql数据库及图片上传接口详解

    django mysql数据库及图片上传接口详解

    这篇文章主要介绍了django mysql数据库及图片上传接口详解,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下
    2019-07-07
  • 小白教你PyCharm从下载到安装再到科学使用PyCharm2020最新激活码

    小白教你PyCharm从下载到安装再到科学使用PyCharm2020最新激活码

    这篇文章主要介绍了PyCharm最新版从下载到安装再到科学使用PyCharm2020最新激活码,需要的朋友可以参考下
    2020-09-09
  • Python中的迭代器详解

    Python中的迭代器详解

    这篇文章主要介绍迭代器,看完文章你可以了解到什么是可迭代对象、啥是迭代器、如何自定义迭代器、使用迭代器的优势,文中有详细的代码示例,需要的朋友可以参考下
    2023-08-08
  • 在Python中操作字典之setdefault()方法的使用

    在Python中操作字典之setdefault()方法的使用

    这篇文章主要介绍了在Python中操作字典之setdefault()方法的使用,是Python入门学习中的基础知识,需要的朋友可以参考下
    2015-05-05
  • 新手如何发布Python项目开源包过程详解

    新手如何发布Python项目开源包过程详解

    这篇文章主要介绍了新手如何发布Python项目开源包过程详解,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下
    2019-07-07
  • 初步解析Python中的yield函数的用法

    初步解析Python中的yield函数的用法

    这篇文章主要介绍了Python中的yield函数,yield函数是生成器中的一个常用函数,本文来自于IBM官方网站的开发者文档的翻译,需要的朋友可以参考下
    2015-04-04
  • pyecharts如何使用formatter回调函数的问题

    pyecharts如何使用formatter回调函数的问题

    这篇文章主要介绍了pyecharts如何使用formatter回调函数的问题,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教
    2023-08-08
  • 用Python和MD5实现网站挂马检测程序

    用Python和MD5实现网站挂马检测程序

    系统管理员通常从svn/git中检索代码,部署站点后通常首先会生成该站点所有文件的MD5值,如果上线后网站页面内容被篡改(如挂马)等,可以比对之前生成MD5值快速查找去那些文件被更改,为了使系统管理员第一时间发现,可结合crontab或nagios等工具
    2014-03-03
  • python 爬取小说并下载的示例

    python 爬取小说并下载的示例

    这篇文章主要介绍了python 爬取小说并下载的示例,帮助大家更好的理解和学习python爬虫,感兴趣的朋友可以了解下
    2020-12-12

最新评论